骨与软组织肿瘤的分类和诊断极为复杂，单纯依靠临床检查和影像学是很难做出正确的诊断，活检是绝大部分骨与软组织肿瘤诊断的必要途径。活检又分为穿刺活检和切开活检。
    穿刺活检是利用粗套管针，取出约0.3*0.3*1cm的组织，送病理诊断。粗套管针穿刺最好是在有大量的骨与软组织肿瘤病例的医院进行，有经验的医生才能拿到肿瘤组织，并且穿刺针道的设计要和手术入路一致，方能在手术中切除，所以，国外主张主刀医生设计穿刺针道。穿刺病理诊断非常困难，样本量少，诊断依赖于有丰富的骨与软组织肿瘤病理经验的专家。困难病理的诊断经常需要骨与软组织肿瘤专科、病理和放射科医生的讨论确诊。在中山大学骨与软组织肿瘤中心，穿刺活检诊断的正确率在90%以上，80年代已经设计出专业化的粗套管针，临床上积累了丰富的经验。经常应用于良性肿瘤，如骨化性纤维瘤、动脉瘤样骨囊肿、骨母细胞瘤、骨巨细胞瘤、脂肪瘤、神经鞘瘤等的诊断，恶性肿瘤：如骨肉瘤、转移瘤、恶性纤维组织细胞增多症、纤维肉瘤、滑膜肉瘤、平滑肌肉瘤等的诊断。手术时间在20分钟以内，手术切口在0.3cm左右，可以在局麻下开展，还有费用低、创伤小、恢复快等优点。穿刺后第二天就可以应用杀死肿瘤细胞的化疗药物。
    切开活检往往在穿刺活检失败后进行，切口约6-8cm,  创伤大，恢复较慢，但取材的病理组织较多，有助于病理医生的全面诊断。穿刺后两周才可以给化疗药物。切开活检也有很多技术细节，例如切口设计一定要在二次手术切除，术中无瘤操作，术后适当引流，防止血肿发生。非常遗憾，一些基层医院开展切开活检后，给二次广泛切除肿瘤的保肢手术带来困难，使患者丧失保肢的机会。